| Gene Region | ||||||||||||||||||||
| Nuclear | Chloroplast | Mitochondria | ||||||||||||||||||
| 生薬名 | 基原 | 5Ss | 18S | ITS1 | 5.8S | ITS2 | 26S | others | trnH-psbA | matK | trnK | trnK-rps16 | trnT-L | trnL | trnL-F | rbcL | rpoC1 | ndhF | others | |
| 茵陳蒿 | Artemisia capillaris Thunberg (IPNI:179314-1) | |||||||||||||||||||
| 鬱金 | Curcuma longa Linné (IPNI:796451-1) | |||||||||||||||||||
| 延胡索 | Corydalis turtschaninovii forma yanhusuo Y.H.Chou et C.C.Hsu (IPNI:888049-1) | |||||||||||||||||||
| 黄耆 | Astragalus mongholicus Bunge (IPNI:478720-1) | |||||||||||||||||||
| Astragalus membranaceus Bunge (IPNI:478611-1) | ||||||||||||||||||||
| 黄芩 | Scutellaria baicalensis Georgi (IPNI:458155-1) | |||||||||||||||||||
| 黄柏 | Phellodendron amurense Ruprecht (IPNI:774774-1) | |||||||||||||||||||
| Phellodendron chinense C.K.Schneider (IPNI:774776-1) | ||||||||||||||||||||
| 黄連 | Coptis japonica Makino (IPNI:710316-1) | |||||||||||||||||||
| Coptis chinensis Franchet (IPNI:710313-1) | ||||||||||||||||||||
| Coptis deltoidea C.Y.Cheng et Hsiao (NCBI:txid261449) | ||||||||||||||||||||
| Coptis teeta Wallich (IPNI:710326-1) | ||||||||||||||||||||
| 遠志 | Polygala tenuifolia Willdenow (IPNI:692440-1) | |||||||||||||||||||
| 葛根 | Pueraria lobata Ohwi (IPNI:214449-2) | |||||||||||||||||||
| Pueraria montana var. thomsonii M.R.Almeida (IPNI:20008484-1) | ||||||||||||||||||||
| 栝楼根 | Trichosanthes kirilowii var. japonica Kitamura (NCBI:txid61011) | |||||||||||||||||||
| Trichosanthes bracteata Voigt (IPNI:294157-1) | ||||||||||||||||||||
| Trichosanthes kirilowii Maximowicz (IPNI:294222-1) | ||||||||||||||||||||
| 乾姜 | Zingiber officinale Roscoe (IPNI:798372-1) | |||||||||||||||||||
| 甘草 | Glycyrrhiza glabra Linné (IPNI:496941-1) | |||||||||||||||||||
| Glycyrrhiza uralensis Fischer ex De Candolle (IPNI:496974-1) | ||||||||||||||||||||
| 莪朮 | Curcuma phaeocaulis Valeton (IPNI:872383-1) | |||||||||||||||||||
| Curcuma zedoaria Roscoe (IPNI:872393-1) | ||||||||||||||||||||
| Curcuma kwangsiensis S.G.Lee et C.F.Liang (IPNI:872373-1) | ||||||||||||||||||||
| 桔梗 | Platycodon grandiflorus A.De Candolle (IPNI:144523-1) | |||||||||||||||||||
| 菊花 | Chrysanthemum morifolium Ramatuelle (IPNI:193606-1) | |||||||||||||||||||
| Chrysanthemum indicum Linné (IPNI:193510-1) |
AB234678 AB234679 AB234680 AB234681 AB234682 AB234683 AB234688 AB234694 AB234695 AB234697 AB234801 AB234802 AB234803 AB234804 AB234805 AB234806 AB234811 AB234817 AB234818 AB234820 AB234842 AB234843 AB234844 AB234845 AB234846 AB234847 AB234852 AB234858 AB234859 AB234861 EF091639 AB234637 AB234638 AB234639 AB234640 AB234641 AB234642 AB234647 AB234653 AB234654 AB234656 |
|||||||||||||||||||
| 枳実 | Citrus aurantium var. daidai Makino (NCBI:txid1925543) | |||||||||||||||||||
| Citrus natsudaidai Hayata (IPNI:771993-1) | ||||||||||||||||||||
| Citrus × aurantium Linné (IPNI:59600-2) | ||||||||||||||||||||
| 羌活 | Notopterygium forbesii H.Boissieu (IPNI:845196-1) | |||||||||||||||||||
| Notopterygium incisum K.C.Ting ex H.T.Chang (IPNI:845199-1) | ||||||||||||||||||||
| 杏仁 | Prunus armeniaca var. ansu Maximowicz (NCBI:txid170481) | |||||||||||||||||||
| Prunus armeniaca Linné (IPNI:729463-1) | ||||||||||||||||||||
| Prunus sibirica Linné (IPNI:324747-2) | ||||||||||||||||||||
| 苦参 | Sophora flavescens Aiton (IPNI:518831-1) | |||||||||||||||||||
| 荊芥 | Schizonepeta tenuifolia Briquet (IPNI:458037-1) | |||||||||||||||||||
| 桂皮 | Cinnamomum cassia Nees ex Blume (IPNI:463346-1) | |||||||||||||||||||
| 紅参 | Panax ginseng C.A.Meyer (IPNI:91472-1) | |||||||||||||||||||
| 香附子 | Cyperus rotundus Linné (IPNI:305797-1) | |||||||||||||||||||
| 厚朴 | Magnolia officinalis Rehder et E.H.Wilson (IPNI:554787-1) | |||||||||||||||||||
| Magnolia officinalis var. biloba Rehder et E.H.Wilson (IPNI:50997083-1) | ||||||||||||||||||||
| Magnolia obovata Thunberg (IPNI:554784-1) | ||||||||||||||||||||
| 牛膝 | Achyranthes fauriei H.Léveillé et Vaniot (IPNI:58726-1) | |||||||||||||||||||
| Achyranthes bidentata Blume (IPNI:58678-1) | ||||||||||||||||||||
| 呉茱萸 | Euodia bodinieri Dode (IPNI:772935-1) |
DQ225821
DQ225822 DQ225823 DQ225824 DQ225831 DQ225832 DQ225854 DQ499601 EF432809 EF432810 EF432811 EF432812 EF432813 EF432814 EF432815 EF432816 EF432817 EF432818 EU592038 EU663533 EU663534 EU663535 EU663536 EU663537 EU663538 EU663539 EU663540 EU663541 EU663542 EU663543 EU663544 EU663545 EU663546 AB699582 |
||||||||||||||||||
| 牛蒡子 | Arctium lappa Linné (IPNI:178385-1) | |||||||||||||||||||
| 五味子 | Schisandra chinensis Baillon (IPNI:60456331-2) | |||||||||||||||||||
| 柴胡 | Bupleurum falcatum Linné (IPNI:839147-1) | |||||||||||||||||||
| Bupleurum chinense De Candolle (IPNI:839099-1) | ||||||||||||||||||||
| 細辛 | Asiasarum sieboldii F.Maekawa (IPNI:93597-1) | |||||||||||||||||||
| Asiasarum heterotropoides var. mandshuricum F.Maekawa | ||||||||||||||||||||
| Asiasarum heterotropoides var. seoulense F.Maekawa | ||||||||||||||||||||
| サフラン | Crocus sativus Linné (IPNI:436688-1) | |||||||||||||||||||
| 山梔子 | Gardenia jasminoides J.Ellis (IPNI:751073-1) | |||||||||||||||||||
| 山茱萸 | Cornus officinalis Siebold et Zuccarini (IPNI:271629-1) | |||||||||||||||||||
| 山椒 | Zanthoxylum piperitum De Candolle (IPNI:775951-1) | |||||||||||||||||||
| 酸棗仁 | Ziziphus jujuba var. spinosa Hu ex H.F.Chou (NCBI:txid714518) | |||||||||||||||||||
| 刺五加 | Eleutherococcus senticosus Maximowicz (IPNI:90431-1) | |||||||||||||||||||
| 芍薬 | Paeonia lactiflora Pallas (IPNI:711802-1) | |||||||||||||||||||
| 車前子 | Plantago asiatica Linné (IPNI:684897-1) | |||||||||||||||||||
| Plantago depressa Willdenow (IPNI:685094-1) | ||||||||||||||||||||
| 生姜 | Zingiber officinale Roscoe (IPNI:798372-1) | |||||||||||||||||||
| 升麻 | Cimicifuga dahurica Huth (IPNI:709429-1) | |||||||||||||||||||
| Cimicifuga foetida Linné (IPNI:709433-1) | ||||||||||||||||||||
| Cimicifuga heracleifolia Komarov (IPNI:709435-1) | ||||||||||||||||||||
| Cimicifuga simplex Wormskjold ex De Candolle (IPNI:709448-1) |
EU591988
FJ597990 AB044408 AB044409 AB194140 AB194141 AB194142 AB194143 AB194144 AB194145 AB194146 AB194147 AB194148 AB194149 AB194150 AB194151 AB194152 AB194153 AB194154 AB194155 AB194156 AB194157 AB194158 AB194159 AB194160 AB194161 AB194162 AB194163 AB194164 AB194165 AB194166 AB194167 AB194168 AB194169 AB194170 AB194171 AB194172 AB194174 AB194175 AB194176 AB194177 Z98298 Z98299 Z98300 Z98301 |
EU591988
FJ597990 AB044408 AB044409 AB194140 AB194141 AB194142 AB194143 AB194144 AB194145 AB194146 AB194147 AB194148 AB194149 AB194150 AB194151 AB194152 AB194153 AB194154 AB194155 AB194156 AB194157 AB194158 AB194159 AB194160 AB194161 AB194162 AB194163 AB194164 AB194165 AB194166 AB194167 AB194168 AB194169 AB194170 AB194171 AB194172 AB194174 AB194175 AB194176 AB194177 Z98298 Z98299 Z98300 Z98301 |
EU591988
FJ597990 AB044408 AB044409 AB194140 AB194141 AB194142 AB194143 AB194144 AB194145 AB194146 AB194147 AB194148 AB194149 AB194150 AB194151 AB194152 AB194153 AB194154 AB194155 AB194156 AB194157 AB194158 AB194159 AB194160 AB194161 AB194162 AB194163 AB194164 AB194165 AB194166 AB194167 AB194168 AB194169 AB194170 AB194171 AB194172 AB194174 AB194175 AB194176 AB194177 Z98298 Z98299 Z98300 Z98301 |
|||||||||||||||||
| 辛夷 | Magnolia kobus De Candolle (IPNI:332100-2) | |||||||||||||||||||
| Magnolia biondii Pampanini (IPNI:554647-1) | ||||||||||||||||||||
| Magnolia sprengeri Pampanini (IPNI:554854-1) | ||||||||||||||||||||
| Magnolia heptapeta Dandy (IPNI:554733-1) | ||||||||||||||||||||
| Magnolia salicifolia Maximowicz (IPNI:554831-1) | ||||||||||||||||||||
| 地黄 | Rehmannia glutinosa var. purpurea Makino | |||||||||||||||||||
| Rehmannia glutinosa Steudel (IPNI:808644-1) |
FJ980430
EU592019 EF363674 FJ770247 FJ770229 FJ770242 FJ770224 FJ770237 FJ770219 FJ770232 FJ770245 FJ770227 FJ770240 FJ770222 FJ770235 FJ770230 FJ770248 FJ770243 FJ770225 FJ770220 FJ770238 FJ770233 FJ770246 FJ770228 FJ770241 FJ770223 FJ770236 FJ770218 FJ770231 FJ770249 FJ770244 FJ770226 FJ770221 FJ770239 FJ770234 DQ069312 EU266022 EU266023 EU266024 EU266025 EU787017 EU787018 EU810383 EU810384 EU810385 EU810386 |
FJ980430
EU592019 EF363674 FJ770247 FJ770229 FJ770242 FJ770224 FJ770237 FJ770219 FJ770232 FJ770245 FJ770227 FJ770240 FJ770222 FJ770235 FJ770230 FJ770248 FJ770243 FJ770225 FJ770220 FJ770238 FJ770233 FJ770246 FJ770228 FJ770241 FJ770223 FJ770236 FJ770218 FJ770231 FJ770249 FJ770244 FJ770226 FJ770221 FJ770239 FJ770234 DQ069312 EU266022 EU266023 EU266024 EU266025 EU787017 EU787018 EU810383 EU810384 EU810385 EU810386 |
FJ980430
EU592019 EF363674 FJ770247 FJ770229 FJ770242 FJ770224 FJ770237 FJ770219 FJ770232 FJ770245 FJ770227 FJ770240 FJ770222 FJ770235 FJ770230 FJ770248 FJ770243 FJ770225 FJ770220 FJ770238 FJ770233 FJ770246 FJ770228 FJ770241 FJ770223 FJ770236 FJ770218 FJ770231 FJ770249 FJ770244 FJ770226 FJ770221 FJ770239 FJ770234 DQ069312 EU266022 EU266023 EU266024 EU266025 EU787017 EU787018 EU810383 EU810384 EU810385 EU810386 |
|||||||||||||||||
| 地骨皮 | Lycium chinense Miller (IPNI:816389-1) | |||||||||||||||||||
| Lycium barbarum Linné (IPNI:816356-1) | ||||||||||||||||||||
| 熟地黄 | Rehmannia glutinosa var. purpurea Makino | |||||||||||||||||||
| Rehmannia glutinosa Steudel (IPNI:808644-1) |
FJ980430
EU592019 EF363674 FJ770247 FJ770229 FJ770242 FJ770224 FJ770237 FJ770219 FJ770232 FJ770245 FJ770227 FJ770240 FJ770222 FJ770235 FJ770230 FJ770248 FJ770243 FJ770225 FJ770220 FJ770238 FJ770233 FJ770246 FJ770228 FJ770241 FJ770223 FJ770236 FJ770218 FJ770231 FJ770249 FJ770244 FJ770226 FJ770221 FJ770239 FJ770234 DQ069312 EU266022 EU266023 EU266024 EU266025 EU787017 EU787018 EU810383 EU810384 EU810385 EU810386 |
FJ980430
EU592019 EF363674 FJ770247 FJ770229 FJ770242 FJ770224 FJ770237 FJ770219 FJ770232 FJ770245 FJ770227 FJ770240 FJ770222 FJ770235 FJ770230 FJ770248 FJ770243 FJ770225 FJ770220 FJ770238 FJ770233 FJ770246 FJ770228 FJ770241 FJ770223 FJ770236 FJ770218 FJ770231 FJ770249 FJ770244 FJ770226 FJ770221 FJ770239 FJ770234 DQ069312 EU266022 EU266023 EU266024 EU266025 EU787017 EU787018 EU810383 EU810384 EU810385 EU810386 |
FJ980430
EU592019 EF363674 FJ770247 FJ770229 FJ770242 FJ770224 FJ770237 FJ770219 FJ770232 FJ770245 FJ770227 FJ770240 FJ770222 FJ770235 FJ770230 FJ770248 FJ770243 FJ770225 FJ770220 FJ770238 FJ770233 FJ770246 FJ770228 FJ770241 FJ770223 FJ770236 FJ770218 FJ770231 FJ770249 FJ770244 FJ770226 FJ770221 FJ770239 FJ770234 DQ069312 EU266022 EU266023 EU266024 EU266025 EU787017 EU787018 EU810383 EU810384 EU810385 EU810386 |
|||||||||||||||||
| 赤芍 | Paeonia lactiflora Pallas (IPNI:711802-1) | |||||||||||||||||||
| 川芎 | Cnidium officinale Makino (IPNI:840466-1) | |||||||||||||||||||
| Ligusticum chuanxiong hort. ex S.H.Qiu et al. (NCBI:txid2689076) | ||||||||||||||||||||
| 蒼朮 | Atractylodes lancea De Candolle (IPNI:182976-1) | |||||||||||||||||||
| Atractylodes chinensis Koidzumi (IPNI:182972-1) | ||||||||||||||||||||
| Atractylodes lancea × Atractylodes chinensis (NCBI:txid334519) | ||||||||||||||||||||
| 桑白皮 | Morus alba Linné (IPNI:30051955-2) | |||||||||||||||||||
| Morus mongolica C.K.Schneider (IPNI:584372-1) | ||||||||||||||||||||
| 蘇葉 | Perilla frutescens var. acuta Kudo (NCBI:txid279737) | |||||||||||||||||||
| Perilla frutescens var. crispa W.Deane (IPNI:190344-2) | ||||||||||||||||||||
| 大棗 | Ziziphus jujuba var. inermis Rehder (NCBI:txid1451284) | |||||||||||||||||||
| 沢瀉 | Alisma orientale Juzepczuk (IPNI:58233-1) | |||||||||||||||||||
| 大黄 | Rheum coreanum Nakai (IPNI:696723-1) | |||||||||||||||||||
| Rheum officinale Baillon (IPNI:696768-1) | ||||||||||||||||||||
| Rheum palmatum Linné (IPNI:696772-1) | ||||||||||||||||||||
| Rheum tanguticum Maximowicz ex Balfour (IPNI:696803-1) | ||||||||||||||||||||
| 竹節人参 | Panax japonicus C.A.Meyer (IPNI:91487-1) | |||||||||||||||||||
| 知母 | Anemarrhena asphodeloides Bunge (IPNI:530140-1) | |||||||||||||||||||
| 丁子 | Syzygium aromaticum Merrill et L.M.Perry (IPNI:601421-1) | |||||||||||||||||||
| 釣藤鈎 | Uncaria sinensis Haviland (IPNI:768314-1) | |||||||||||||||||||
| Uncaria macrophylla Wallich (IPNI:768275-1) | ||||||||||||||||||||
| Uncaria rhynchophylla Miquel (IPNI:768297-1) | ||||||||||||||||||||
| 猪苓 | Polyporus umbellatus Fries (GBIF:5246840) | |||||||||||||||||||
| 陳皮 | Citrus unshiu Marcowicz (IPNI:772094-1) | |||||||||||||||||||
| Citrus reticulata Blanco (IPNI:772038-1) |
GQ248747 EF590436 GQ248434 GQ247928 AY095445 AY690321 DQ001754 F590806 EF590862 EF590931 EF118864 EF118865 EF126537 EF126538 EF126604 EF134669 EF134670 EF164849 EF164850 EF176533 EF176534 |
|||||||||||||||||||
| Citrus reticulata × Citrus unshiu (NCBI:txid558540) | ||||||||||||||||||||
| 天麻 | Gastrodia elata Blume (IPNI:635522-1) | |||||||||||||||||||
| 天門冬 | Asparagus cochinchinensis Merrill (IPNI:531041-1) | |||||||||||||||||||
| 当帰 | Angelica acutiloba var. sugiyamae Hikino (IPNI:60470529-2) | |||||||||||||||||||
| Angelica acutiloba Kitagawa (IPNI:837548-1) | ||||||||||||||||||||
| 桃仁 | Prunus persica var. davidiana Maximowicz | |||||||||||||||||||
| Prunus persica Batsch (IPNI:1212858-2) |
AY179512
AY179513 AY179514 AY179515 AY179516 AY179517 AY179518 AY179519 AY179520 AY179521 AY179522 AY179523 AY179524 AY179525 AY179526 AY179527 AY179528 AY179529 AY179530 AY179531 AY179532 AY179533 AY179534 AY179535 AY179536 AY179537 AY179538 AY179539 AY179540 AY179541 AY179542 AY179543 AY179545 AY179544 AY179546 AY179547 AY179548 AY179549 AY179550 AY179551 AY179552 AY179553 AY179554 AY179555 AY179556 AY179557 AY179558 L28749 |
|||||||||||||||||||
| 人参 | Panax ginseng C.A.Meyer (IPNI:91472-1) | |||||||||||||||||||
| 薄荷 | Mentha arvensis var. piperascens Malinvaud [=Mentha canadensis (NCBI:txid294733)] | |||||||||||||||||||
| 半夏 | Pinellia ternata Teore ex Breitenbach (IPNI:88088-1) | |||||||||||||||||||
| 貝母 | Fritillaria verticillata var. thunbergii Baker | |||||||||||||||||||
| 麦門冬 | Ophiopogon japonicus Ker Gawler (IPNI:429781-1) | |||||||||||||||||||
| 白芷 | Angelica dahurica Bentham et Hooker filius ex Franchet et Savatier (IPNI:60451989-2) | |||||||||||||||||||
| 白朮 | Atractylodes japonica Koidzumi ex Kitamura (IPNI:182974-1) | |||||||||||||||||||
| Atractylodes macrocephala Koidzumi (IPNI:182978-1) | ||||||||||||||||||||
| 檳榔子 | Areca catechu Linné (IPNI:664107-1) | |||||||||||||||||||
| 茯苓 | Wolfiporia cocos Ryvarden et Gilbertson (GBIF:2549306) | |||||||||||||||||||
| 附子 | Aconitum car | |||||||||||||||||||